L'un des objectifs majeurs du PRPV est d'augmenter les échanges commerciaux à l'échelle de la sous-région. Cela ne peux se concrétiser que par l'harmonisation régionale des législations phytosanitaires des pays membres de la COI. En réglementant la qualité du matériel végétal ainsi que les procédures d'importation et d'exportation, les importateurs évitent ainsi l'introduction sur leur territoire d'organismes nuisibles et d'agents pathogènes.

Dans la même optique, le PRPV aide les pays à s'aligner sur les législations internationale dans l'objectif d'ouvrir leurs exportations aux marchés européens et internationaux.