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  • Formations au diagnostic moléculaire des maladies émergentes bactériennes et virales

Publié le 11 Juil 2007
Dernière modification le 16 Juil 2008

Le stage « Diagnostic moléculaire des maladies émergentes bactériennes et virales » a été délivré en 2006 au Pôle de Protection des Plantes à St-Pierre de la Réunion, par le Cirad et le Service de protection des végétaux. Deux autres stages ont suivi en 2008, l'un portant plus spécifiquement sur le diagnostic moléculaire d'une bactérie (Ralstonia solanacearum) et l'autre, sur l'utilisation de nouveaux outils (PCR multiplex), mis au point dans le cadre du PRPV, sur tomate et pomme de terre.

Au programme du 1er stage de deux semaines :

  • des cours théoriques en bactériologie, virologie et techniques de diagnostic
  • des travaux dirigés sur quelques exemples de maladies émergentes (Begomovirus, Crinivirus), sur l’analyse des séquences oligonucléotidiques et sur la recherche de documents bibliographiques.
  • des visites sur le terrain pour observer et prélever des symptômes viraux (TYLCV et ToCV) et bactériens (Xanthomonas sp. pv mangiferaeindicae, Xanthomonas axonopodis pv. allii).
  • des manipulations en laboratoire : extraction d’ADN total de plante, PCR, clonage, préparation de milieu...

Ce stage avait été initié en 2004 et portait à l'origine sur le diagnostic sérologique.

Les deux autres stages ont suivi en 2008 :

  • une semaine au mois de juin sur le diagnostic de Ralstonia solanacearum par PCR
  • une semaine début juillet sur l'utilisation des outils PCR multiplex :
    • une PCR multiplex sur tomate pour la détection de Ralstonia solanacearum et Clavibacter michiganensis subs. michiganensis
    • deux RT- PCR multiplex sur pomme de terre pour la détection du (i) PLRV et PVS ainsi que (ii) la détection du Ralstonia solanacearum, Clavibacter michiganensis subs. sepedonicus, PVX, PVA et PVY.

Formateurs :
Olivier PRUVOST, chercheur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Isabelle SOUSTRADE, chercheur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Daphné LINDERME, ingénieur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Jean-Michel LETT, chercheur virologiste au CIRAD Réunion
Philippe PRIOR, chercheur phytopathologiste à l'INRA accueilli au CIRAD Réunion




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